68465

Аминокислоты, пептиды и белки

Лекция

Химия и фармакология

Для записи аминокислотных остатков в макромолекулах пептидов и белков используют трехбуквенные сокращения их тривиальных названий (см. табл. 1). –аминокислоты – кристаллические вещества, растворимые в воде. Часть из них обладает сладким вкусом.

Русский

2014-09-22

820 KB

4 чел.

Лекция № 7,8.

Аминокислоты, пептиды и белки.

Аминокислоты – гетерофункциональные соединения, содержащие старшую карбоксильную группу (–СООН) и аминогруппу (–NH2). По положению NH2–группы относительно СООН–группы различают –, –, –кислоты. Пептиды и белки организма состоят только из –аминокислот, в молекулах которых обе функции находятся при одном и том же атоме углерода.

    

Общий фрагмент

     

Основная функция                NH2–СН–СООН               Кислотная функция

     R Радикал

 Названия –аминокислот строятся по заместительной номенклатуре, но обычно используются их тривиальные названия, чаще связанные с источником выделения.

НООС – СН2 – СН – СООН                         2-аминобутандиовая кислота, аспарагиновая кислота

выделена из спаржи (от лат. asparagus - спаржа).

НО – СН2 – СН – СООН   2-амино-3-гидроксипропановая кислота, серин входит в

состав фиброина шелка (от лат. serieus – шелковистый).

Для записи аминокислотных остатков в макромолекулах пептидов и белков используют трехбуквенные сокращения их тривиальных названий (см. табл. 1).

 –аминокислоты – кристаллические вещества, растворимые в воде. Часть из них обладает сладким вкусом. Основным источником –аминокислот для живого организма служат пищевые белки. Многие –аминокислоты синтезируются в организме, некоторые же необходимые для синтеза белков –аминокислоты не синтезируются в организме и должны поступать извне. Такие аминокислоты называют незаменимыми: валин, лейцин, изолейцин, лизин, треонин, метионин, фенилаланин, триптофан (см. табл. 1).

Таблица 1. Важнейшие –аминокислоты.

R – CH – COOH

Строение R

Название

Сокращенное название аминокислотного остатка

Алифатические

Н –

СН3

(СН3)2СН –

(СН3)2СН – СН2

СН3 – СН2 – СН –

Содержащие ОН–группу

НО – СН2

СН3 – СН –

Содержащие СООН–группу

НООС – СН2

НООС – СН2 – СН2

Содержащие NH2СО–группу

NH2СО – СН2

NH2СО – СН2 – СН2

Содержащие NH2-группу

NH2 – (СН2)3 – СН2

NH2 – С – NH – (СН2)2 – СН2

Серусодержащие

HS – CH2

CH3 – S – CH2 – CH2

Ароматические

– СН2

НО –           – СН2

Гетероциклические

(полная формула)

Глицин

Аланин

Валин

Лейцин

Изолейцин

Серин

Треонин

Аспарагиновая

Глутаминовая

Аспарагин

Глутамин

Лизин

Аргинин

Цистеин

Метионин

Фенилаланин

Тирозин

Триптофан

Гистидин

Пролин

Gly

Ala

Val

Leu

Ile

Ser

Thr

Asp

Glu

Asn

Gln

Lys

Arg

Cys

Met

Phe

Tyz

Trp

His

Pro

 Незаменимые –аминокислоты.

При некоторых заболеваниях, чаще врожденных, перечень незаменимых кислот расширяется. Например, при кетонурии (слабоумие) не синтезируется организмом тирозин ( у здоровых людей он получается гидроксилированием фенилаланина).

Медико-биологическое значение –аминокислот заключается в том, что они участвуют в синтезе белков организма. Все многообразие пептидов и белков зависит от состава и различного сочетания –аминокислот их образующих.

Классификация –аминокислот.

  1.  По химической природе радикала
  2.  Алифатические –аминокислоты составляют наиболее многочисленную группу: Gly, Ala, Val, Leu, ILe, Ser, Thr, Asp, Glu, Asn, Gln, Lys, Arg, Cys, Met.
  3.  Ароматические и гетероциклические: Phe, Tyr, Trp, His, Pro. Циклы отделены от –аминокислотного фрагмента группой –СН2–. Это позволяет свободное вращение циклов при формировании пространственной структуры белка.
  4.  По числу групп –СООН и –NH2 в молекуле
  5.  Нейтральные или моноаминомонокарбоновые (1–СООН и 1–NH2): Gly, Ala, Val и т.д.
  6.  Основные или диаминомонокарбоновые (1–СООН и 2–NH2): Lys, Arg.
  7.  Кислые или моноаминодикарбоновые (2–СООН и 1–NH2): Glu, Asp.
  8.  По полярности бокового радикала
  9.  –аминокислоты с неполярным (гидрофобным) радикалом: Ala, Leu, Val и т.д.
  10.  –аминокислоты с полярным радикалом (гидрофильным), содержащим полярные группировки (ОН–, SH–, COOH–, NH2–):

а) ионогенные – способные к ионизации в условиях организма, например, фенольный гидроксил тирозина.

б) неионогенные – неспособные переходить в ионное состояние в организме, например, спиртовый гидроксил серина.

В белках ионогенные группы располагаются на поверхности и обуславливают электростатическое взаимодействие. Неионогенные располагаются как на поверхности белка, так и внутри и образуют водородные связи. Таким образом, и те и другие участвуют в формировании пространственной структуры белка.

Стереоизомерия –аминокислот.

Все –аминокислоты, кроме глицина, имеют центр хиральности и потому оптически активны.

              СООН                                   СООН                       Принадлежность к D– и L– ряду

определяют по глицериновому

 Н – С* – NH2                 NH2 –  С* – Н                   альдегиду.

 

                   R                                           R 

    D–аминокислота             L–аминокислота

Энантиомеры

Почти все природные –аминокислоты относятся к L–ряду, а в построении белков организма участвуют только L–аминокислоты. С этим связана стереоспецифичность ферментов: они состоят из L–аминокислот и расщепляют белки, состоящие только из L–аминокислот. Расщепление же белков из D–аминокислот ферментативно невозможно. По этой причине ферменты животных и человека абсолютно бессильны перед вирусом «сибирской язвы», так как в состав белка вируса входит D–глутаминовая кислота.

Формы существования –аминокислот

в зависимости от реакции среды.

Наличие двух функциональных групп – кислотного (СООН–) и основного (NH2–) характера обуславливает амфотерность –аминокислот. Между ОН– кислотным центром (к.ц.) карбоксильной группы и основным центром (о.ц.) группы –NH2 по донорно-акцепторному механизму идет образование диполярного иона (цвиттер–иона).

R – CH – C – OH                                        R – CH – C – O    +  H+             R – CH – COO

                       к.ц.  диссоциирует по типу

     о.ц.                     слабого электролита        о.ц.                 акцептор

                                                                        донор                                      диполярный ион

В водном растворе –аминокислота существует в виде равновесной смеси диполярного иона, катионной и анионной форм. Положение равновесия зависит от pH среды. Общим для всех –аминокислот является преобладание катионных форм в сильнокислых                       (рН~1) и анионных – в сильнощелочных (рН~11) средах.

                                     Н+                                          – Н+

NH3+ – CH – COOH                NH3+ – CH – COO                  NH2 – CH – COO

                                     + Н+        + Н+

Катионная форма                     Диполярный ион                    Анионная форма

(рН~1,0) Сильнокислая среда                     рН~7,0                      Сильнощелочная среда (рН~11,0)

Значение рН, при котором суммарный заряд молекулы –аминокислоты (белка) равен 0, называется изоэлектрической точкой (pI), а состояние –аминокислоты (белка) – изоэлектрическим.

Нейтральные –аминокислоты

Имеют значения pI в слабокислой среде, например, у аланина pI 6,0.

  – Н+                                       – Н+

   + Н+                                       + Н+

    Катион   Диполярный ион                      Анион

   рН~1,0                                       рI 6,0                                   рН~11,0

В условиях организма при рН крови 7,36 нейтральные –аминокислоты существуют в анионной форме.

Кислые –аминокислоты.

Имеют pI в кислой среде, например, у глутаминовой кислоты pI 3,22.

         – Н+                                     – Н+                                 – Н+

                                + Н+                                    + Н+                                  + Н+

    Катион                       Диполярный ион                        Анион                          Дианион

     pН~1,0                            pI 3,22                                                                         pH~11,0

В условиях организма при рН крови 7,36 кислые –аминокислоты существуют в анионной форме.

Основные –аминокислоты.

Имеют pI в щелочной среде, например, у лизина pI 9,7.

                         – Н+                                – Н+                                                – Н+

                         + Н+                               + Н+                                + Н+

Дикатион                    Катион                       Диполярный ион                   Анион

 pН~1,0                                                                 pI 9,7

В условиях организма при рН крови 7,36 основные –аминокислоты существуют в катионной форме.

Химические свойства –аминокислот.

  1.  Образование солей по кислотному и основному центрам (амфотерность –аминокислот).

                                                + NaOH                 R – CH – C – ONa      +     H2O                  

R – CH – C – OH                                                             (соль)                                  

                       к.ц.                   + HCl                    R – CH – COOH

      о.ц.

       (соль)

  1.  С катионами тяжелых металлов Hg, Pb, Cd, Cu–аминокислоты как бифункциональные соединения образуют внутрикомплексные соли (хелаты), которые понижают растворимость –аминокислот.

Реакция с Cu2+ является качественной на –аминокислотный фрагмент – образуется комплекс синего цвета.

  1.  Свойства по группе –СООН:

а) образование амидов

         SN(H+)

R – CH – C – OH     +     H – N – X                         R – CH – C – N – X     +     H2O

          амидная связь

X – остаток другой –аминокислоты, алифатический или ароматический радикал.

Амидная связь прочная, гидролизуется только в сильнокислой или сильнощелочной среде. Амидной связью соединены остатки –аминокислот в пептидах и белках.

б) образование эфиров

    HCl сух.           + NH3 

R – CH – C – OH     +     H – OCH3                   R – CH – C – O – CH3                   R – CH – C – O – CH3

     – Н2О            – NH4Cl

смесь –аминокислот                                                          сложно-эфирная связь

Реакция этерефикации обратима. Для выделения свободных эфиров смесь обрабатывают газообразным аммиаком. Все реактивы должны быть безводными. Эфиры не имеют биполярного строения и, в отличие от –аминокислот, не растворяются в воде, а растворяются в органических растворителях. Эфиры летучи. Это используют для разделения –аминокислот путем эфирной перегонки их метиловых эфиров (предложена Фишером в 1901 году).

в) декарбоксилирование (удаление группы –СООН из –аминокислотного фрагмента) «in vivo» идет под действием ферментов декарбоксилаз и кофермента пиридоксальфосфата. В результате образуются биогенные амины. Декарбоксилирование возможно из-за электроноакцепторного влияния –NH3+ в –положении.

         фермент

              – СН2 – СН – СОО                                      – СН2 – СН2NH2

          – СО2

                                                                                        Гистамин – биогенный амин, имеет отношение

   гистидин                                                                     к аллергическим реакциям организма.

       фермент

                 – СН – СОО        – СН2 – СН2NH2

         – СО2

      Триптофан                                                                                            Триптамин токсичен

       фермент                                             

НООС – СН2 – СН2 – СН – СОО                               НООС – СН2 – СН2 – СН2NH2 

        – СО2             –аминомасляная (ГАМК) является

Глутаминовая                                                               нейромедиатором головного мозга.

ГАМК под названием гаммалон или аминалон применяется при лечении нервно-психических заболеваний. При нагревании ГАМК подобно –оксикислотам подвергается внутримолекулярной циклизации с образованием лактама. Лактамы – это циклические амиды, гидролизуются в кислой и щелочной среде.

    to

          –H2O    -бутиро лактам        (пирролидон–2)

На основе пирролдиона–2 синтезированы замещенные по N лактамы:

пирацетам (ноотропил) –                     поливинилпирролидон –

влияет на мышление                             эффективный заменитель плазмы крови

Для незамещенных по N лактамов характерна лактам–лактимная таутомерия – динамическое равновесие между лактамной и лактимной формой, вызванное свободной обратимой миграцией Н между N и О в фрагменте цикла  – NC

 лактам                             лактим

  1.  Свойства –аминокислот по группе –NH2:

А) образование оснований Шиффа (иминов) с альдегидами (присоединение – отщепление).

     

     +         AN          Е

R – C              +     H – N – CH – COOH                           R – C – N – CH – COOH    

                 – Н2О

альдегид                    –аминокислота                               карбиноламины неустойчивы    

                    RCH = NCHCOOH    Имин (основание Шиффа)

 

Реакция с формальдегидом лежит в основе количественного определения –аминокислот методом формального титрования (метод Серенсена). Амфотерный характер –аминокислот не позволяет проводить их титрование щелочью. При взаимодействии –аминокислот с формальдегидом получаются относительно устойчивые карбиноламины, свободную карбоксильную группу которых титруют щелочью.

    

     +              +NaOH

H – C           +     H – N – CH – COOH            CH2 – N – CH – COOH               CH2 – N – CH – COONa

              H2O 

формальдегид      –аминокислота            устойчивый карбиноламин                натриевая соль

–аминокислоты

б) дезаминирование (удаление NH2–группы) – важная реакция организма. Так снижается избыток –аминокислот в организме. (Пути образования NH3 в организме).

Неокислительное (без О2) дезаминирование «in vivo» встречается в грибах, бактериях, ведет к образованию непредельных - и - кислот.

     аспартаза

НООС – СН – СН – СООН                                             С = С

       аспарагиновая                                          фумаровая кислота

 Окислительное дезаминирование «in vivo» идет с участием дегидрогеназ и кофермента НАД+ или НАДФ+ и ведет к образованию токсического NH3, который включается в организме в цикл мочевины.

            ф-т            + Н2О

RCCOOH   +   НАД+             НАДН   +   Н+   +   RCCOOH               RCCOOH   +   NH3   

        окислен.        восстан.

–аминокислота    форма           форма                     –иминокислота           –оксокислота     аммиак

Дезаминирование «in vitro» с азотной кислотой (HNO2) используют для количественного определения –аминокислот (метод Ван-Слайка).

R – CH – COOH     +     HNO2        R – CH – COOH     +     H2O     +     N2

–аминокислота                            –гидроксикислота                         по количеству N2 судят о

      количестве –аминокислоты

  1.  Специфические реакции –аминокислот «in vivo». Некоторые –аминокислоты, находясь в составе белков, подвергаются химической модификации, которая связана с изменениями радикала. Чаще всего это окислительные процессы.

А) гидроксилирование – введение в боковой радикал ОН–группы. Например, в молекуле белка коллагена идет гидроксилирование лизинового остатка                                 гидроксилаза   

NH2 – CH2 – CH – CH2 – CH2 –      +       O2     +     НАДН    +     Н+

радикал лизина в молекуле коллагена

                                                                     NH2CH2CHCH2CH2 –      +       НАД+    +     Н2О

                                                                     фрагмент β-гидроксилизина  

Б) Обратное окисление тиогрупп лежит в основе ряда окислительно-восстановительных процессов в клетке.

HS – CH2 – CH – COOH                                                 S – CH2 – CH – COOH

        окисление

HS – CH2 – CH – COOH         восстановление             S – CH2 – CH – COOH

             Цистеин                                                                  цистин

Превращение цистеина в цистин приводит к образованию дисульфидных мостиков, которые участвуют в формировании третичной структуры белка.

Благодаря легкому окислению тиольных групп, цистеин выполняет защитную функцию при действии на организм окислителей.

В) Карбоксилирование имеет большое значение для свертывания крови. В радикал глутаминовой кислоты белка протромбина вводится СООН–группа. Это приводит к связыванию Са2+ и превращению протромбина в тромбин.

                                  Карбоксилирование                        + Са2+

–СН2 – СН2 – СОО                                     – СН2 – СН                                – СН2 – СН                    Са2+

радикал глутаминовой                                 фрагмент тромбина

в протромбине

Принципиальный путь биосинтеза катехоламинов.

Катехоламины – представители биогенных аминов, которые образуются в результате метаболизма незаменимой –аминокислоты фенилаланина. К катехоламинам относятся дофамин, норадреналин и адреналин. Как и ацетилхолин, они выполняют роль нейромедиаторов. Адреналин является гормоном надпочечников, а норадреналин и дофамин – его предшественники. Адреналин участвует в регуляции сердечной деятельности и обмена углеводов. При стрессах выделяется в кровь («гормон страха»).

             гидроксилаза

                      – СН2 – СН – СООН                        НО –           – СН2 – СН – СООН

              фенилаланин                                                               тирозин

     гидроксилаза         декарбоксилаза

                    – СН2 – СН – СООН                                                – СН2 – СН2

                                  3,4-дигидроксифенилаланин                                              дофамин

дофамин--оксидаза      N-метилтрансфераза

                                                          – СН–СН2NH2                                                        –СН–СН2N

 

               Норадреналин                                                               Адреналин

Пептиды и белки.

Природные или синтетические вещества, построенные из остатков –аминокислот, соединенных пептидными связями, называются пептидами.

Если пептиды содержат меньше 10 остатков –аминокислот, их называют олигопептиды; от 10 до 100 – полипептиды, выше 100 – белки.

Пептиды и белки пищи в желудочно-кишечном тракте под действием ферментов – пептидаз подвергаются полному гидролизу до свободных –аминокислот, из которых организм синтезирует собственные белки.

Пептидную или белковую молекулу можно представить как продукт поликонденсации –аминокислот, в котором остатки –аминокислот соединены пептидными (амидными) связями.

H2N – CH – C – OH     +     H – N – CH – C – [OH   +  …   H]– NCHCOH 

N–конец                    С–конец

               

               H2N – CH – C –  N – CH – C –   …  N – CH – C – OH

                           р,-сопряжение

Пептидная связь из-за р,-сопряжения жесткая, вращение вокруг нее затруднено. Полипептидная цепь имеет линейное строение и представляет собой первичную структуру белка. Цепь имеет начало – N-конец и конец – С-конец.

Классификация белков (протеинов).

  1.  По биологическим функциям
  2.  Структурные белки – строительный материал (кератин, эластин, коллаген).
  3.  Транспортные белки (гемоглобин, миоглобин).
  4.  Сократительные (актин, миозин).
  5.  Защитные (иммуноглобулины).
  6.  Регуляторные (гормоны).
  7.  Ферментативные (биокатализаторы).
  8.  Запасные (казеин, ферритин).
  9.  Токсические (змеиные яды, дифтерийный токсин).
  10.  По составу
  11.  Простые (неконьюгированные) белки при гидролизе дают только –аминокислоты.
  12.  Сложные (коньюгированные), кроме белковой части, содержат простатическую группу (небелковую):

а) гемопротеины содержат простатическую группу гем;

б) фосфопротеины – остаток фосфорной кислоты;

в) металлопротеины – ионы металла;

г) гликопротеины – углеводную часть;

д) липопротеины – липидную часть;

е) нуклеопротеины – фрагменты нуклеиновых кислот;

  1.  По пространственной структуре
  2.  Глобулярные белки. Характерна –спиральная структура, молекулы имеют форму сферы (альбумин – яичный белок, глобин – белковая часть гемоглобина, миоглобин, почти все ферменты). При растворении в воде образуют коллоидные системы.
  3.  Фибриллярные белки. Характерна -структура, волокнистое строение (-кератин волос и роговой ткани, -фиброин шелка, мионозин мускульной ткани, коллаген соединительной ткани). Фибриллярные белки не растворимы в воде.

PAGE  7


EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

EMBED Word.Picture.8  

  1.  

 

А также другие работы, которые могут Вас заинтересовать

49392. Описание структуры с именем NOTE 50.63 KB
  Описать структуру с именем NOTE, содержащую следующие поля: - фамилия, имя; - номер телефона; - дата рождения (массив из трех чисел); Написать программу, выполняющую следующие действия: - ввод с клавиатуры данных в массив, состоящий из восьми элементов типа NOTE; записи должны быть упорядочены по датам рождения; - вывод на экран информации о человеке, номер телефона которого введен с клавиатуры; - если такого нет, выдать на дисплей соответствующее сообщение.
49393. Описание структуры с именем STUDENT 231 KB
  Содержание проекта: Постановка задачи и метод решения. Алгоритм модулей и главной функции. Листинг программы. Результаты тестирования программы. Таблица переменных, задействованных в программе. Список использованных источников.
49394. Гидравлический расчёт трубопровода 329.91 KB
  Значение кинематической вязкости жидкости при Т =20С м 2 с Выбор и обоснование расчетной схемы Рассматриваемый участок трубопровода представляет собой пять параллельных труб. Таким образом данный участок трубопровода относится к классу трубопроводов с параллельными участками. В результате расчета необходимо определить расходы через каждый участок трубопровода и построить гидравлические характеристики отдельных участков и всего трубопровода в целом. Список условных обозначений использованных в расчетах Величины: Q общий расход через...
49397. Протокол SNMP и его применение 188.57 KB
  Архитектурная модель SNMP представляет собой набор станций сетевого управления и управляемых сетевых элементов. Протокол SNMP используется для обмена информацией между станциями сетевого управления и сетевыми элементами. На станциях сетевого управления выполняются программы, которые обеспечивают мониторинг, и управление сетевыми элементами - так называемые менеджеры. В сетевых элементах реализуется программный агент...
49398. Расчет ходовых частей железнодорожного подвижного состава 4.69 MB
  ХОДОВЫЕ ЧАСТИ ПОДВИЖНОГО СОСТАВА Особенностями ходовых частей железнодорожного подвижного состава влияющими на конструктивное оформление рельсовой колеи являются: наличие реборд гребней у бандажей колес; глухая насадка колес; параллелизм осей в пределах жесткой базы; поперечные разбеги осей подвижного состава а также наличие у некоторых экипажей поворотной оси или тележки; коничность бандажей. Колесная пара железнодорожного экипажа состоит из оси и двух наглухо насаженных колес с бандажами...
49399. Устройство сбора телеметрической информации. Оценка измеряемой величины с порогом 239.5 KB
  Микро ЭВМ цифровая ЭВМ с интерфейсом ввода вывода состоящая из МП памяти и при необходимости пульта управления и источников питания объединенных в единой несущей конструкции. ША предназначена для передачи адресов от МП к блоку памяти и внешних устройств. Программа обработки с распределением команд по ячейкам памяти. Адрес памяти Метка Команда мнемоника код Число тактов Время выполнения Комментарий 8000h LXI D 8037h 10 10 Запись адреса ячейки памяти предназначенную для данных с датчиков в регистр D 80030h M0 MVI B Fh 06 7 35 Записываем...
49400. Проектирования газотурбинного двигателя мощностью 16 МВт для привода нагнетателя природного газа, на базе конвертированного авиационного двигателя НК-16-СТ 955.65 KB
  Кратко даны обоснование и описание конструкции газотурбинного привода, технология эксплуатации, рассмотрены вопросы безопасности и экологичности проекта, стандартизации и метрологии, определена экономическая эффективность инвестиций замены ГТД. В качестве иллюстрации полученных результатов выполнен ряд графических работ.